有害物質を取り扱う方や、リスクの高い作業を行う方に対する健康診断です。
特殊健診にはさまざまな種類があり、業種や取り扱っている化学物質等により義務付けられているものもあります。
現在、44種類の有機溶剤及び11種類の特別有機溶剤で実施が義務付けられています。取り扱う溶剤によって検査項目が異なります。
・問診及び医師の診察（自他覚症状の有無と内容）
・検尿（蛋白）
・尿代謝物検査（馬尿酸・メチル馬尿酸・総三塩化物・メチルホルムアミド・2.・5－ヘキサンジオンの測定）
・肝機能検査（血清AST（GOT）・ALT（GPT）・γ-GTPの測定）
・腎機能検査（血中BUN・クレアチニンの測定）
・貧血検査（赤血球数・ヘモグロビン値の測定）
・眼底検査（眼底カメラによる眼底写真）
・問診（業務歴の調査）
・胸部エックス線検査
胸部エックス線写真を撮影
・問診及び医師の診察（業務歴の調査・既往歴・自他覚症状の有無と内容）
・血中鉛
・尿中デルタアミノレブリン酸
・問診及び医師の診察（被曝歴（業務歴）の調査・既往歴・自他覚症状の有無と内容）
・血液検査（白血球数・赤血球数・ヘモグロビン又はヘマトクリットと白血球分類の測定）
現在、62種類の物質で実施が義務付けられています。物質ごとに検査項目が異なります。以下は、代表的な物質です。
・問診及び医師の診察（業務歴・作業条件の調査・既往歴・自他覚症状の有無と内容）
・胸部エックス線検査（場合により）
胸部エックス線写真を撮影
・問診及び医師の診察（業務歴・作業条件の調査・既往歴・自他覚症状の有無と内容）
・問診及び医師の診察（業務歴の調査・既往歴・自他覚症状の有無と内容）
・胸部エックス線検査
胸部エックス線写真を撮影
VDT作業・騒音・振動・金銭登録・キーパンチャー・腰痛・赤紫外線 等（31種類）
それぞれ、規定された検査項目があります。
なお、法律（労働安全衛生規則）に定められた身体に負担や危険性の大きい特定有害業務では、通常年に一回行う定期一般健康診断と同じ項目を、半年に一度行うことが義務付けられています。